Дабы не выкачивать весь сайт с помощью медленного FTP, лучше воспользоваться SSH. Чтобы создать zip архив файлов открываем Putty и пишем:

zip -r archivename.zip /path_to_folder

А чтобы распаковать архив на другом хостинге пишем в Putty:

unzip archivename.zip